Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xab2Q9DCD2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms