Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms