Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Riok3Q9DBU3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms