Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Smg9Q9DB90 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smg9Q9DB90 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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