Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DA42 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DA42 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DA42 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DA42 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9DA42 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9DA42 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms