Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms