Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms