Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms