Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms