Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rep15Q9D7T1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rep15Q9D7T1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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