Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms