Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec23bQ9D662 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms