Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms