Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn11Q9D572 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn11Q9D572 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms