Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Zcchc13Q9D548 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms