Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc83Q9D4V3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc83Q9D4V3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms