Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clvs1Q9D4C9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms