Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D454 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D454 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D454 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D454 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D454 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D454 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D454 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D454 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D454 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms