Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933436I01RikQ9D3T1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4933436I01RikQ9D3T1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms