Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx20Q9D2Y5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx20Q9D2Y5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms