Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
D930007J09RikQ9D2K6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D930007J09RikQ9D2K6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms