Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem53Q9D0Z3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms