Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbed3Q9D0L1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zbed3Q9D0L1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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