Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfc5Q9D0F6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rfc5Q9D0F6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfc5Q9D0F6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rfc5Q9D0F6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rfc5Q9D0F6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rfc5Q9D0F6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Rfc5Q9D0F6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rfc5Q9D0F6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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