Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2e1Q9D0D5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms