Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnajc18Q9CZJ9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnajc18Q9CZJ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnajc18Q9CZJ9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnajc18Q9CZJ9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnajc18Q9CZJ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajc18Q9CZJ9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajc18Q9CZJ9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnajc18Q9CZJ9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms