Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl55Q9CZ83 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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