Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gtpbp8Q9CY28 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gtpbp8Q9CY28 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gtpbp8Q9CY28 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtpbp8Q9CY28 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms