Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Bud23Q9CY21 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Bud23Q9CY21 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Bud23Q9CY21 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Bud23Q9CY21 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Bud23Q9CY21 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bud23Q9CY21 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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