Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms