Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ddx28Q9CWT6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ddx28Q9CWT6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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