Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca4Q9CWM2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca4Q9CWM2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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