Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2310003L06RikQ9CV82 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
2310003L06RikQ9CV82 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms