Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhobtb3Q9CTN4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms