Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fcf1Q9CTH6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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