Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Sft2d3Q9CSV6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sft2d3Q9CSV6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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