Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rprd1bQ9CSU0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rprd1bQ9CSU0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms