Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR55 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR55 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR55 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR55 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR55 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR55 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR55 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR55 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR55 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR55 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR55 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Q9CR55 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR55 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR55 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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