Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PpidQ9CR16 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PpidQ9CR16 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PpidQ9CR16 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PpidQ9CR16 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PpidQ9CR16 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PpidQ9CR16 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpidQ9CR16 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms