Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4931417E11RikQ9CR05 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms