Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PclafQ9CQX4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PclafQ9CQX4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms