Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok2Q9CQS5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms