Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb9Q9CQJ8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms