Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd2aQ9CQJ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms