Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudt21Q9CQF3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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