Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms