Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lyrm1Q9CQB7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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