Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnaseh2cQ9CQ18 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnaseh2cQ9CQ18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rnaseh2cQ9CQ18 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rnaseh2cQ9CQ18 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnaseh2cQ9CQ18 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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