Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg3Q9CPX6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms