Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsbg1Q99PU5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsbg1Q99PU5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsbg1Q99PU5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsbg1Q99PU5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsbg1Q99PU5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms